Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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