Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms