Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms