Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Gm5798F7BTS7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Gm5798F7BTS7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Gm5798F7BTS7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Gm5798F7BTS7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Gm5798F7BTS7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm5798F7BTS7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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