Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms