Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms