Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pate1E9Q658 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms