Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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