Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms