Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gcom1E9PZ54 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms