Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms