Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan18E9PUD6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms