Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20521D3Z5F7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20521D3Z5F7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms