Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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