Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm3259D3YUK0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm3259D3YUK0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm3259D3YUK0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm3259D3YUK0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm3259D3YUK0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm3259D3YUK0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm3259D3YUK0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Gm3259D3YUK0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Gm3259D3YUK0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gm3259D3YUK0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gm3259D3YUK0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gm3259D3YUK0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm3259D3YUK0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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