Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phf11cB4XVP9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Phf11cB4XVP9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Phf11cB4XVP9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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