Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6133B2RY53 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms