Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc8B2RUS7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms