Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms