Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apba1B2RUJ5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms