Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms