Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NhsB1AV60 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NhsB1AV60 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NhsB1AV60 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NhsB1AV60 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NhsB1AV60 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NhsB1AV60 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NhsB1AV60 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NhsB1AV60 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NhsB1AV60 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NhsB1AV60 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NhsB1AV60 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NhsB1AV60 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NhsB1AV60 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms