Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms