Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Skint4A7TZF3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Skint4A7TZF3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Skint4A7TZF3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Skint4A7TZF3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Skint4A7TZF3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Skint4A7TZF3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Skint4A7TZF3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Skint4A7TZF3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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