Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5640A3KG49 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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