Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf39A2RT81 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms