Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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