Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms