Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ambra1A2AH22 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms