Protein–RNA interactions for Protein: A2AEU1

Mcf2, Mcf.2-transforming sequence, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcf2A2AEU1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mcf2A2AEU1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mcf2A2AEU1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms