Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbbp8nlA2ABX0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms