Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms