Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap29-1A2A5X4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms