Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RNP2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms