Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm3238W4VSP7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm3238W4VSP7 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm3238W4VSP7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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