Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms