Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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