Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms