Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Krt27Q9Z320 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Krt27Q9Z320 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Krt27Q9Z320 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Krt27Q9Z320 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms