Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer1Q9Z2Y3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms