Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mrpl40Q9Z2Q5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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