Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms