Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms