Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pdpk1Q9Z2A0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdpk1Q9Z2A0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdpk1Q9Z2A0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdpk1Q9Z2A0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdpk1Q9Z2A0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdpk1Q9Z2A0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdpk1Q9Z2A0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdpk1Q9Z2A0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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