Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms