Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S5

Sept3, Neuronal-specific septin-3, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept3Q9Z1S5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Sept3Q9Z1S5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sept3Q9Z1S5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sept3Q9Z1S5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sept3Q9Z1S5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sept3Q9Z1S5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sept3Q9Z1S5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sept3Q9Z1S5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept3Q9Z1S5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms