Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVC5

Trpc7, Short transient receptor potential channel 7, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc7Q9WVC5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Trpc7Q9WVC5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc7Q9WVC5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trpc7Q9WVC5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trpc7Q9WVC5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trpc7Q9WVC5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trpc7Q9WVC5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc7Q9WVC5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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