Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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