Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms