Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmfrQ9R049 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms